設定項目では、特に「スマホ用」「PC用」という切り分けはありませんが、ご質問内容は

「パソコンで見ると反映されているのにスマホで見るとトップ画像が表示されない」

という意味でしょうか？

スマホで見るとHandmadeのデザインではなくなってしまっている場合、やはり「モバイルテーマを使用をOFF」が関連しています。デザイン設定でOFFにした後に、確実に設定が保存されているかどうか確認してみてください。

どうしても解決しない場合、URLをお知らせいただければこちらで確認させていただきます。
どうぞよろしくお願いいたします。