ご質問ありがとうございます。
テーマをHTML編集Appでカスタマイズされていますでしょうか？BASEではカスタマイズされている場合はアップデートの上書きがされてしまわないように別テーマとして保管されます。
ご購入済みテーマはオリジナルの状態で最新版をご利用いただけるようになっていますので、テーマ一覧の「購入したデザイナーズテーマ」にあるRelationを適用してみてください。
よろしくお願いいたします。

RelationのテーマをHTML編集Appでカスタマイズしております。

HTML編集Appでカスタマイズされているのですね。上にご案内しました通り、カスタマイズされた場合はそのカスタマイズ内容が勝手に上書きがされてしまわないよう別テーマとして保管されます。
お知らせバナーAppは12月にリリースされたAppなので、最新版のアップデートにて対応しています。

ご購入済みテーマは常に最新版をご利用いただけるようになっていますので、テーマ一覧の「購入したデザイナーズテーマ」にあるRelationを適用してみてください。
その最新版に対して、改めて同じようにカスタマイズを施すことで、双方のバージョンを合流させることができるかと思います。
 
どうぞ宜しくお願いいたします。