ご質問ありがとうございます。
> カートボタンを商品ページの上部と下部に2つ設定できないか
について、テーマ設定として現時点ではそのような機能はありませんが、カスタマイズとしては可能だと思います。
単純な発想としてはHTML編集にてカートボタンを出力しているコードを丸ごと、商品説明カスタムAppの後に複製するという考えになると思います。
カートボタン付近は価格表示などを含めコードが複雑になっていますが、試していただく分にはすぐに可能ですので挑戦してみていただければと思います。

テーマはサイト全体全ての商品反映されるものであり、商品ごとにそれを変えることはできない（もし商品説明が短い商品があった場合、単にカートが２重表示された状態になってしまう）ため、たくさんのショップ様でご利用いただいているテーマの機能として実装するには、かなり慎重なリサーチが必要となります。
ただお買い物がしやすくなるということに繋がる部分でもありますので、積極的に検討してみたいと思います。
貴重なご意見、ありがとうございます。
どうぞよろしくお願いいたします。