ロゴを新しく作成ということは、テキストではなく新しく専用デザインを作るという解釈でよろしいでしょうか？
テーマ側ではサイズ制限はありませんが、縦横比はテーマによって少し関係してくると思います。
MASTERPIECEの場合、ヘッダーのスペースが横長の長方形で取られているため、どちらかというと横長ロゴの方がぴったりとはまりやすはなると思います。
既にMASTERPIECEをご利用ということなので、仮の画像などをロゴ画像にアップしてみてどうなるかを試していただくのが最も良いと思います。
 
どうぞよろしくお願いいたします。