もし解決されたら、一言ご報告いただけると嬉しいです。

ありがとうございます。入れ込みに関しては出来ました。
動画のサイズ調整や動画位置などの変更もできるのでしょうか？

サイズも再生位置も、YouTubeの動画URLを取得する段階で自分で選ぶ設定ではなかったでしょうか？

位置ですが、言葉足らずで申し訳ございません。
現在、動画を埋め込むとページ下部の「カートに入れる」ボタンの下に来ており、
これを上部に持っていきたいのですが、うまく出来ません。
動画サイズに関しましてはありがとうございます。
試してみます。

「商品説明カスタムApp」の内容がどこに表示されるか（カートボタンの上なのか下なのか）はテーマによると思います。　
デザインの好みはやはりテーマを選んで頂くしかないと思いますので、ぜひいろいろ見てみてください。

ありがとうございます。
かしこまりました。